פוטנציאל הנזק בשטחי החקלאות יסתמך על שכבת השימושים החקלאיים העדכנית שתתקבל ממשרד החקלאות וביטחון המזון, באמצעות לשונית 8 'שטחים חקלאיים', ובהסתמך על נתוני הנזק לקבוצות שימושים חקלאיים כפי שמופיע בטבלה.
הפוליגונים של השטחים החקלאיים יוגדרו תחת קטגוריית שטחים חקלאיים. בשדה ייעוד משנה, יש לכתוב את קבוצות שוות הנזק לפי האקסל התכנוני (לולים, מטעים וכו').
במידה וקיימת חלקה מסומנת בשכבת החלקות החקלאיות של משרד החקלאות כשהיא מקוטלגת כשונות / לא מעובד – העלות תהיה כשל גד"ש, כולל שטחי שוליים של חלקות בפשט הצפה.
הערה חשובה: שכבות התכניות גוברות על שכבת החקלאות. בכל מקום בו קיימת תכנית, גם אם לא מומשה, יחושב פוטנציאל הנזק בהתאם לשימוש הקרקע העתידי, ולא עפ"י השימוש החקלאי הנוכחי. כמו כן, שימושים של מט"ש ומאגר יחושבו לפי שכבות התכניות, ורק בריכות דגים יחושבו בהתאם לשכבת החקלאות.

שכבת השימושים החקלאיים זו מורכבת משכבות ה- GIS הבאות של משרד החקלאות:

1. מבני בעלי חיים (ללא לולים) – השכבה כוללת מבנים לבקר, לצאן, ולשימושים נוספים כגון אורווה, מתבן וכד', אשר קובצו לקבוצה שוות נזק אחת.
2. לולים – השכבה כוללת סוגי לולים שונים, אשר קובצו לקבוצה שוות נזק אחת.
3. חלקות חקלאיות – הכוללת פירוט של סוגי הגידולים החקלאיים.
4. בריכות דגים
5. שכבת גופי מים – בנט"ל
   .

שלבי עבודה עיקריים להצגה:

1. שטחים חקלאיים באזור פשט ההצפה
   
2. שטח פשט ההצפה על גבי שכבת השטחים החקלאיים
   
3. שטחים חקלאיים בתחום פשט ההצפה
   
4. שטחים חקלאיים בפשט ההצפה אשר לא חלה בהם אף תכנית (זוהי השכבה שנתוניה מהווים בסיס לחישוב פוטנציאל הנזק)